Если у вас стоит к примеру LibreOffice Writer, то по умолчанию редактирование файлов происходит в нем. А что если мы хотим открывать и редактировать в Kate? Все просто, когда первый раз открываем файл на редактирование в FileZilla, он создает запрос как мы хотим его открыть и там есть вот такая строка.
/usr/bin/libreoffice --writer %f
Выбираем программу по выбору, и для того чтобы определить путь и указать его используем вот такой запрос
which kate
Получаем
/usr/bin/kate
Аналогично вписываем любой редактор, и находи его путь. Ассоциации после открытия для редактирования файлов на сервере автоматически добавляются сами, например так: